Le domaine carboxy-terminal de l'ARN polymérase II : un pivot du métabolisme des ARN messagers en général et du VIH en particulier.

Abstract

L’ARN polymérase II des eucaryotes est formée de plusieurs sous-unités. La plus grande possède un domaine carboxy- terminal (CTD) remarquable, composé de très nombreuses répétitions (26 chez la levure, 52 chez les mammifères) d’un motif conservé de sept acides aminés dont cinq peuvent être phosphorylés. Seul le CTD déphosphorylé permet l’assemblage de l’ARN polymérase II et des facteurs généraux de transcription sur les promoteurs. La phosphorylation du CTD par le facteur de transcription TFIIH est nécessaire à l’élongation de la transcription mais d’autres CTD-kinases semblent aussi impliquées. Le CTD phosphorylé servirait ensuite à recruter les systèmes enzymatiques impliqués dans la maturation des ARN prémessagers. Dans une cellule, l’état de phosphorylation du CTD dépend d’une compétition entre des protéine kinases et des protéines phosphatases. Les conditions de croisance cellulaire affecteraient cet équilibre et pourraient ainsi moduler le métabolisme des ARN messagers.

RNA polymerase (RNAP) II is a multisubunit enzyme composed of several different subunits. The largest subunit shows an intriguing carboxy-terminal domain (CTD) which consists in multiple repeats of seven amino-acid motif. The same motif is repeated 26 times in the yeast protein and up to 52 times in the mammalian protein. An unphosphorylated CTD is essential for the assembly of RNA polymerase and general transcription factors into a preinitiation complex of transcription on promoters. Phosphorylation of the CTD by the transcription factor TFIIH is required to elongate transcription, but other CTD kinases may also contribute to it. The CTD is also required for pre-mRNA splicing and polyadenylation. But in this case, phosphorylation of the CTD is necessary to associate the splicing machinery. In cells, the phosphorylation status of the CTD of the largest subunit is tightly regulated by a balance between protein kinases and phosphatases. Environmental and developmental programs influence this balance and may thus directly influence the overall mRNA metabolism. [References: 53]