Milieu Intérieur : Comprendre l’hétérogénéité du système immunitaire sain pour avancer sur la voie de la médecine personnalisée
Résumé
Le projet Milieu Intérieur vise à élucider les facteurs
environnementaux et héréditaires qui façonnent un système immunitaire sain, et à
définir ses frontières lors de l’homéostasie et à la suite d’une stimulation
immunitaire. Le projet repose sur un phénotypage immunitaire de 1 000 donneurs
sains. En corrélant les mesures obtenues par analyse en cytométrie en flux de la
composition des cellules immunitaires du sang périphérique en homéostasie avec
les métadonnées associées, nous avons défini des valeurs de référence de
phénotypes en fonction du sexe et de l’âge et constaté un impact significatif du
tabagisme et de l’infection latente par le cytomégalovirus sur les phénotypes
mesurés. Nous avons également identifié onze nouveaux polymorphismes (SNP,
single-nucleotide polymorphism), associés à des phénotypes
spécifiques de certaines cellules immunitaires. Des conduites expérimentales
robustes et standardisées ont été établies pour quantifier les signatures
protéiques et transcriptionnelles de la réponse immunitaire résultant de la
stimulation des cellules du sang périphérique et pour explorer les déterminants
génétiques et non-génétiques de la variabilité de cette réponse. Les approches
analytiques établies par Milieu Intérieur et l’ensemble des
données recueillies pourront ainsi servir de référence pour des études
comparatives avec différentes maladies. The Milieu Intérieur project aims to define the boundaries of a
healthy immune system in steady state and upon immune stimulation, and to
elucidate environmental and hereditary determinants of its variability. The
project is based on an in-depth immune phenotyping of 1 000 healthy donors. By
correlating the cytometry measurements of peripheral blood immune cell
composition in homeostasis, with the associated metadata, we have defined
reference values of phenotypes related to sex and age, and found a significant
impact of latent cytomegalovirus infection and smoking on measured phenotypes.
In addition, we identified eleven novel Single-Nucleotide
Polymorphisms (SNPs) associated with immune cell phenotypes. Immune
response signatures were measured upon stimulation of fresh peripheral blood by
40 immune stimuli. Robust and standardized pipelines were established to
quantify expression of 29 proteins and 572 genes and to explore genetic and
non-genetic determinants of the variability of healthy immune response. The
analytical approaches established by Milieu Intérieur and the
collected data set represent an ideal reference for comparison studies of
disease populations.
Pour citer ce document
Hasan, Milena ; Milieu Intérieur : Comprendre l’hétérogénéité du système immunitaire sain pour
avancer sur la voie de la médecine personnalisée, Med Sci (Paris), Vol. 35, N° 5 ; p. 423-430 ; DOI : 10.1051/medsci/2019077