Le test de troncation des protéines (PTT) : un outil pour la détection de mutations dans l'ADN.

Date
1998Auteur
Maugard, C
Tuffery, S
Beaufrère, L
Bareil, C
Claustres, M
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Metadata
Afficher la notice complèteRésumé
La détection de mutations dans
l’ADN représente une étape essentielle
de la biologie moléculaire, pour la
recherche fondamentale comme pour
les applications médicales. Les
stratégies actuellement disponibles
pour déceler les allèles mutés sont
fondées, soit sur l’utilisation de
méthodes rapides mais limitées à
l’identification d’un nombre restreint
de mutants déterminés, soit sur
l’utilisation de techniques coûteuses
et laborieuses mais capables de déceler
la moindre altération de séquence
dans les portions essentielles des
gènes. La détection de mutations est
une démarche complexe et aucune des
méthodes disponibles n’est applicable
seule à toutes les situations, leur
choix dépendant de nombreux critères
(nature des mutations, taille et
structure du gène, accès à l’ARNm,
degrés d’efficacité et de sensibilité
recherchés). Nous présentons les
avantages relatifs d’une stratégie de
recherche spécifique des mutations
qui introduisent un signal d’arrêt
prématuré de la synthèse protéique,
fondée sur le test de troncation des
protéines (PTT), par rapport aux
techniques classiques de balayage
d’un fragment d’ADN ou d’ARN
telles que l’électrophorèse en gel de
gradient dénaturant (DGGE),
l’analyse d’hétéroduplex (HA),
l’analyse de conformation de l’ADN
en simple brin (SSCA) ou le clivage
chimique ou enzymatique de
mésappariements (CCM/EMC). Le
PTT, fondé sur l’analyse de
fragments d’ARN ou d’ADN
transcrits et traduits in vitro, paraît
être, pour certaines maladies
génétiques, la façon la plus efficace et
la moins coûteuse de déceler les
mutations de l’ADN responsables de
troncation protéique. Mutation detection is one of the most important areas of molecular biology today; allowing the identification of new alleles for diagnostic, population genetics and structure/functions studies. Strategies for mutation detection can be divided into two groups: those that rely on cheap techniques that efficiently identify a small number of known disease alleles and those that rely on expensive and time-consuming techniques capable of scanning the genes for unknown mutations. Mutation detection is a field of considerable complexity and no single method is applicable for all situations. The most appropriate procedures are influenced bp the expected nature of mutations, size and structure of genes, availability of mRNA, efficiency requested and resources available. In this study we present the relative advantages of the protein truncation test (PTT) among the other scanning methods such as denaturing gel electrophoresis (DGGE), heteroduplexes analysis (HA), single strand conformational analysis (SSCA) or chemical/enzymatic mismatch clivage (CCM/EMC). The PTT, based on in vitro transcription/translation of stretches of DNA or RNA, appears as one of the most efficient and cost effective way to detect mutations that result in premature protein translation. [References: 24]
Pour citer ce document
Maugard, C ; Tuffery, S ; Beaufrère, L ; Bareil, C ; Claustres, M, Le test de troncation des protéines (PTT) : un outil pour la détection de mutations dans l'ADN., Med Sci (Paris), 1998, Vol. 14, N° 4; p.467-74